Joniškio sinagogų kompleksas – unikalus išlikęs dviejų mūrinių XIX a. sinagogų kompleksas Lietuvoje, kuris ne tik restauruotas, bet ir pritaikytas visuomeninėms reikmėms. Manoma, kad XVIII a. antroje pusėje Joniškio mieste apsigyveno pirmieji žydai. Miesto valdžia leido žydams prekiauti miesto turguje ir prekymečiuose, todėl žydų bendruomenė sparčiai gausėjo. 1797 m. jiems leista pasistatyti sinagogą ir paskirtas sklypas kapinėms. Baltąja vadinama sinagoga pastatyta 1823 m., joje harmoningai susipina skirtingų architektūrinių stilių  dermė – vėlyvąjį klasicizmą ir romantizmą papildo barokinis puošnumas – ne veltui ji nuolat vadinta tiesiog Gražiąja. Įspūdinga tiek grožiu, tiek dydžiu, ši sinagoga buvo regiono žydų pasididžiavimas – joje vykdavo iškilmingos pamaldos, nuolat svečiuodavosi geriausi kantoriai ir chazanai, kuriuos žavėjo sinagogos sienas puošę ištapyti senieji muzikos instrumentai. Ši didelė ir erdvi sinagoga buvo nešildoma, tad veikė tik šiltuoju metų laiku, o žiemą bendruomenė rinkdavosi šalia buvusioje mažesnėje šildomoje sinagogoje. Pastaroji, Raudonoji sinagoga, pastatyta 1865 m., savo pavadinimą gavo dėl netinkuoto raudonų plytų fasado.

Sovietmečiu sunaikintas abiejų sinagogų originalus išplanavimas ir eksterjero puošyba, jose įrengti sandėliai, sporto salė. Šiuo metu sinagogų kompleksas restauruotas, priklauso Joniškio krašto muziejui ir yra naudojamas visuomeninėms reikmėms. Jose vyksta įvairūs renginiai, koncertai, paskaitos, skirtos žydų kultūrai ir jos paveldo pristatymui bei išsaugojimui.